Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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