Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc29Q80VM3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc29Q80VM3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc29Q80VM3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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