Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Avl9Q80U56 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Avl9Q80U56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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