Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lamp3Q7TST5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms