Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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