Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms