Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms