Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp397Q7TNK4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms