Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms