Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Trpv1Q704Y3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms