Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Topbp1Q6ZQF0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms