Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms