Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms