Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GcsamQ6RFH4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GcsamQ6RFH4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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