Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd1Q6PIP5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms