Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Lce3fQ6PAI4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms