Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC061212Q6P8K3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms