Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms