Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Podnl1Q6P3Y9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms