Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms