Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sp140Q6NSQ5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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