Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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