Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q66JV7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms