Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim24Q64127 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim24Q64127 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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