Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PatjQ63ZW7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms