Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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