Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms