Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms