Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sema3bQ62177 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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