Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PcolceQ61398 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PcolceQ61398 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcolceQ61398 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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