Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms