Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms