Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms