Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms