Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms