Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tdrd5Q5VCS6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tdrd5Q5VCS6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd5Q5VCS6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms