Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd40Q5SUE8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd40Q5SUE8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms