Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tns3Q5SSZ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tns3Q5SSZ5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tns3Q5SSZ5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tns3Q5SSZ5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms