Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms