Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms