Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri2Q5BKS4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms