Protein–RNA interactions for Protein: Q571I4

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q571I4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAG1Q571I4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAG1Q571I4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms