Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms