Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc27a5Q4LDG0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc27a5Q4LDG0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc27a5Q4LDG0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc27a5Q4LDG0 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc27a5Q4LDG0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc27a5Q4LDG0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc27a5Q4LDG0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc27a5Q4LDG0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a5Q4LDG0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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