Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syne3Q4FZC9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms