Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp48Q3V0C5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Usp48Q3V0C5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp48Q3V0C5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp48Q3V0C5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp48Q3V0C5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp48Q3V0C5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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