Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330034G19RikQ3UWX6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms