Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms