Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E330014E10RikQ3UL33 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms