Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms